Nel 1886 Paolo Michon donò all'Arciconfraternita un piccolo camposanto che si trovava in una sua proprietà in località La Cigna, usato in precedenza come luogo di sepoltura dei frati minori.

Il cimitero, benedetto nel novembre 1888, è stato ingrandito a più riprese e restaurato dopo la seconda guerra mondiale.

Nella cappella dedicata alla Santa Croce, benedetta il 14 settembre 1889, si trovano le tombe di alcuni Canonici della cattedrale, tra i quali lo scrittore e noto storico della città di Livorno Can. Giuseppe Piombanti, di padre Agostino Morando parroco militare della guarnigione di Livorno, del conte Balì Demetrio Carlo Finocchietti, governatore dell'Arciconfraternita, e del cav. Giuseppe Michon.

In un loculo sono raccolte le ossa rinvenute il primo novembre 1899 durante i lavori di scavo nella piazza della Fortezza vecchia, dove si trovavano fino al 1525 l'antica Pieve di S. Maria e Giulia e il primo cimitero del Sodalizio.